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——外顯子組測序鑒定范可尼貧血癥患兒分子缺陷
上海兒童醫(yī)學中心檢驗科傅啟華教授團隊與天昊生物合作，利用全外顯子組測序技術成功的鑒定出一例范可尼貧血癥兒童的分子缺陷，文章發(fā)表于gene雜志。天昊生物為此項研究提供了外顯子組測序及后續(xù)生物信息分析的工作，天昊生物生物信息部經理李才華作為文章的作者之一分享了這一研究成果。
范可尼貧血（Fanconi anemia）是一種罕見的常染色體隱性遺傳性血液系統(tǒng)疾病，以幼年發(fā)生的進行性骨髓衰竭和多發(fā)性的先天畸形為本病的兩大重要特征。該病讓細胞不能修復DNA損傷，因為修復能力的缺乏，范可尼貧血癥患者是很多癌癥的高危人群，尤其是白血病以及頭部和頸部癌癥。
研究表明，范可尼貧血根據致病機理至少可以分為15個基因亞型，最經典的診斷方法通常是通過交聯(lián)劑（ICLs）或者絲裂霉素C（MMC）誘導的染色體斷裂試驗來評估病人的細胞敏感性。對于范可尼貧血癥患者來說進一步確診其相應的分子缺陷是個很大的挑戰(zhàn)。傳統(tǒng)的突變分析受到各種因素制約而難以開展，如果通過互補分析法獲得候選基因再結合桑格爾測序或多重連接探針擴增技術也可以確定突變。但是互補分析也受到各種條件制約，所以如果跳過互補分析，直接進行高通量測序，是個很好的選擇，也是目前臨床醫(yī)學越來越普遍的方法。
在本研究中，傅啟華教授團隊通過臨床特征結合各項理化指標及體外實驗，確診為FA，未進行互補分析，直接外顯子組測序，發(fā)現(xiàn)了4個雜合突變位點。值得注意的是有兩個雜合位點均位于FANCA 基因。桑格爾測序驗證了這兩個突變分別來自患兒的父母。并且其中一個突變位點是未報道過的位點c.989_995del。在接下來的交聯(lián)劑（ICLs）誘導的染色體斷裂實驗中，證明了該位點的存在增加了基因組的不穩(wěn)定性，該位點的致病性得到了進一步的驗證。當然如果這個位點在其他的病人中得到進一步的驗證，會成為該位點致病性的更有力證據。
在外顯子組測序過程中，天昊生物借助多名長期從事于基因及遺傳分析領域的專家對測序結果進行了專業(yè)細致的分析，協(xié)助傅啟華教授團隊得到了可喜的科研成果。希望我們精湛的技術、豐富的專業(yè)知識與真摯的態(tài)度能協(xié)助更多科研工作者在攀登科學高峰的荊棘路上攻克技術難題，突破科研瓶頸，取得豐碩的科研成果。 文章信息 Zhaojing Zheng, Juan Geng, Ru-en Yao, Caihua Li, Daming Ying, Yongnian Shen, Lei Ying, Yongguo Yu, Qihua Fu. Molecular defects identified by whole exome sequencing in a child with Fanconi anemia. Gene. 530 (2013) 295–300  |
