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內(nèi)容提要:北京阜外醫(yī)院中-德實驗室陳敬洲等人,發(fā)現(xiàn)angiopoietin-1的3’UTR區(qū)的一個單核苷酸多態(tài)可以通過干擾與microRNA211的結(jié)合從而降低發(fā)生卒中的危險,該研究成果于2010年4月發(fā)表在Human Molecular Genetics上。
技術(shù)思路:
1、首先研究人員根據(jù)對卒中的致病機理的理解,進行了合理的推測:腦血管滲漏和炎癥是卒中的兩個重要致病進程,因此作者假設(shè)調(diào)控血管形成素-1表達的microRNA對卒中發(fā)生有重要影響;
2、通過生物信息學(xué)預(yù)測angiopoietin-1的調(diào)控microRNA,同時發(fā)現(xiàn)RS2507800位于microRNA211的結(jié)合區(qū)域內(nèi);
3、使用雙熒光素酶報告基因檢測系統(tǒng)在A549細(xì)胞系上初步驗證該位點多態(tài)性影響angiopoietin-1蛋白的表達;
4、最后做病例-對照研究,在人群中驗證該位點與疾病的關(guān)系
點評:本研究的亮點有:
1、 對疾病的臨床機理有深刻的理解,從而大膽假設(shè),小心求證;
2、 從本質(zhì)入手,先證明該位點的功能,再做病例-對照研究,反推回現(xiàn)象上進行驗證
3、 生物信息學(xué)的合理運用,隨著信息技術(shù)的不斷更新進步,在以后的科研中妥善利用生物信息技術(shù)將給科學(xué)研究帶來更多的發(fā)現(xiàn)
目前對于功能性SNP位點的研究仍然具有重要意義,不過研究者在立題之初就應(yīng)沉著冷靜,不要盲目動手,結(jié)合自身對疾病機理的理解和猜測,大膽假設(shè)小心求證,會有不錯的新發(fā)現(xiàn)。
參考文獻: A functional variant in the 3’-UTR of angiopoietin-1 might reduce stroke risk by interfering with the binding ef?ciency of microRNA 211
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